Лаборатория масс-спектрометрической метаболомной диагностики

Статистика научной деятельности



О лаборатории

Лаборатория создана в 2012 году.
Зав. лабораторией – к.б.н. Лохов Петр Генриевич,
                                 (e-mail: lokhovpg@rambler.ru)
Штат лаборатории – 5 сотрудников
Расположение – ИБМХ, корпус 2, этаж 6, комната 658

Основное направление деятельности лаборатории связано с проведением метаболомных исследований биологических жидкостей организма для характеристики функционирования биологического объекта в патологическом состоянии и разработки методов диагностики на основе метаболитов – низкомолекулярные (до 1500 Да) органические соединения, которые являются субстратами, интермедиаторами или продуктами биохимических реакций. Метаболомика является завершающей стадией постгеномных исследований, и выявленные низкомолекулярные вещества дают исчерпывающую информацию о состоянии больного, наличии у него патологических процессов, эффективности проводимой лекарственной терапии, риске возникновения заболеваний, последствиях воздействия на организм экологических факторов. Основным материалом исследования является плазма/сыворотка крови человека, как наиболее информативная в плане лабораторной диагностики и доступная в клинике биологическая жидкость организма. Основным методом исследования метаболитов плазмы крови является масс-спектрометрический анализ низкомолекулярных веществ.

Штат лаборатории укомплектован высококвалифицированными специалистами, имеющими практические навыки в области биохимии и масс-спектрометрического анализа.

ОСНОВНЫЕ НАПРАВЛЕНИЯ РАБОТ

  1. Метаболомное профилирование плазмы крови больных социально значимыми заболеваниями.
    Масс-спектрометрический анализ метаболитов плазмы/сыворотки крови для разработки методов диагностики и оценки риска возникновения социально значимых заболеваний -рак простаты, рак легкого, колоректальный рак, диабет, нейродегенеративные заболевания, сердечно- сосудистые заболевания.
  2. Фармакометабономика
    Данное направление лаборатории реализует современный подход к персонализированной лекарственной терапии на основе анализа метаболического профиля, являющегося интегральным показателем интенсивности катаболизма ксенобиотиков в организме, текущего состояния организма и генетически детерминированной реакции на лекарственную терапию конкретного пациента.

Сотрудники


Оборудование

ОБОРУДОВАНИЕ

  • Масс-спектрометр micrOTOF-Q Bruker Daltonics
  • Масс-спектрометр maXis Impact Bruker Daltonics
  • Хроматографическое оборудование

Публикации

ПУБЛИКАЦИИ

2013

  1. Trifonova O.P., Lokhov P.G., Archakov A.I. Postgenomics diagnostics: Metabolomics approaches to human blood profiling. OMICS: A Journal of Integrative Biology 2013, vol: 17(11), pages: 550-559.
  2. Трифонова О.П., Ильин В.А., Колкер Е.В., Лисица А.В. «Большие данные» в биологии и медицине. Acta Naturae, 2013, том: 3(18), стр: 14-17.
  3. Trifonova O.P., Il’in V.A., Kolker E.V., Lisitsa A.V. Big data in biology and medicine. Acta Naturae, 2013, vol: 3(18), pages:13-16.
  4. Lokhov PG, Balashova EE, Universal cancer vaccine: an update on the design of cancer vaccines generated from endothelial cells, Human Vaccines & Immunotherapeutics, 2013, vol: 9(7), pages: 1549-1552
  5. Trifonova O.P., Lokhov P.G., Archakov A.I. Metabolic profiling of human blood. Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry, 2013, vol: 7(3), pages: 179-186.
  6. Lokhov P.G. Balashova E.E., Tumor-induced endothelial cell surface heterogeneity directly affects endothelial cell escape from a cell-mediated immune response in vitro, Human Vaccines & Immunotherapeutics, 2013, vol: 9(1), pages: 198-209
  7. Lokhov P.G., Trifonova O.P., Maslov D.L., Archakov A.I. Blood plasma metabolites and the risk of development of lung cancer in Russia. European Journal of Cancer Prevention, 2013, vol: 22(4), pages: 335-341.
  8. Трифонова О.П., Пастушкова Л.Х., Саменкова Н.Ф., Чернобровкин А.Л., Карузина И.И., Лисица А.В., Ларина И.М. Исследование протеома плазмы крови здорового человека в условиях длительной изоляции в гермообъекте. Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. 2013, том: 155(1), стр: 43-46.
  9. Trifonova O.P., Pastushkova L.Kh., Samenkova N.F., Chernobrovkin A.L., Karuzina I.I., Lisitsa A.V., Larina I.M. Investigation of the blood plasma proteome of healthy men during long-term isolation in hermoobject. Bull Exp Biol Med., 2013, vol: 155(1), pages: 37-39.

2012

  1. Petushkova N.A., Larina O.V., Chernobrovkin A.L., Trifonova O.P., Kisrieva Yu.S., Lisitsa A.V., Karuzina I.I., Archakov A.I. Optimization of the SDS-PAGE gel slicing approach for identification of human liver microsomal proteins via MALDI-TOF mass spectrometry. Journal of Proteomics & Bioinformatics, 2012, vol: 5(2), pages: 040-049.
  2. Lokhov P.G., Kharibin O.N. Archakov A.I. Diagnosis of lung cancer based on direct-infusion electrospray mass spectrometry of blood plasma metabolites. International Journal of Mass Spectrometry. 2012, vol: 309, pages: 200-205
  3. Balashova E.E., Dashtiev M.I., Lokhov P.G., Proteomic footprinting of drug-treated cancer cells as a measure of cellular vaccine efficacy for the prevention of cancer recurrence, Molecular & cellular proteomics, 2012, vol: 11(2)M111.014480, pages: 1-7
  4. Kisrieva Yu.S., Petushkova N.A., Chernobrovkin A.L., Larina O.V., Trifonova O.P., Samenkova N.F., Kuznetsova G.P., Karuzina I.I., Kashirtseva N.V., Belyaeva N.F., Lisitsa A.V. The proteomic study of Danio rerio embryos using one-dimensional electrophoresis and mass-spectrometry. Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry, 2012, vol: 6(1), pages: 23-30.