Лаборатория нанобиотехнологии

Статистика научной деятельности


О лаборатории

Основным направлением научной деятельности лаборатории является проведение фундаментальных и прикладных работ в протеомике и медицинской диагностике с использованием нанотехнологических устройств. Исследовательские работы проводятся с помощью устройств на основе АСМ (атомно-силового микроскопа), электронного микроскопа, масс-спектрометра, нанопроводного молекулярного детектора и лазерного корреляционного спектрометра.

Метод АСМ предоставляет принципиальную возможность визуализировать и проводить подсчет отдельных белковых макромолекул и их комплексов. С помощью АСМ проводятся следующие исследования биологических объектов (белков, олигонуклеотидов):

  1. АСМ-визуализация единичных молекул и биомолекулярных комплексов.
  2. Разработка фундаментальных основ детекции единичных биомолекул из растоворов аналитов с помощью комбинации методов АСМ и биоспецифического фишинга.
  3. Создание АСМ-наночипов для медицинской протеомики.
  4. Определение физико-химических свойств единичных молекул (single molecule enzymology) с помощью АСМ.
  5. Создание системы сопряжения АСМ и масс-спектрометра для задач медицинской диагностики.

Прикладные направления исследований:

  1. Создание выскочувствительных устройств для медицинской диагностики, в частности атомно-силовых диагностических комплексов с высокочувствительными АСМ-нанобиочипами для диагностики инфекционных и онкологических заболеваний, которые позволяют проводить диагностику заболеваний на уровне единичных молекул. На сегодняшний день существует лабораторный прототип такого устройства. Развитие производства сдерживается в связи с отсутствием медицинского рынка высокотехнологической продукции в этой области. 
  2. Создание высокочувствительных нанопроводных молекулярных детекторов для диагностики инфекционных и онкологических заболеваний заболеваний на уровне единичных вирусных и микробных частиц (совместно с ИФП СО РАН).
  3. Создание наночипов на базе многоканальных нанопроводных молекулярных детекторов для медицинской протеомики (совместно с ИФП СО РАН).

Тел.: +7 (499) xxx-xx-xx

Сотрудники


Проекты


Текущие проекты

  1. Разработка фундаментальных основ детекции единичных молекул белка с помощью АСМ и нанопроводных молекулярных детекторов. 2009-2010гг. РФФИ 09-04-12113-офи_м.
  2. Построение молекулярных моделей металлсвязывающих фрагментов природных форм бета-амилоида и разработка методики идентификации низкокопийных белков. 2009-2010гг. ГК 02.512.11.2334.

Завершенные проекты

  1. Выявление и идентификация белков-партнеров цитохром Р4502B4-содержащей монооксигеназной системы в микросомальной фракции с помощью комбинации оптического биосенсора и масс-спектрометра. 2005-2007гг. ГК 05-04-48690-а.

Результаты

РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ И РАЗРАБОТОК

  1. Методики АСМ-визуализации и детекции единичных биомолекул.
  2. Прототип нанотехнологического комплекса на базе атомно-силовых микроскопов для диагностики гепатитов В и С.
  3. Разработка молекулярных регистрирующих систем для протеомики и на основе АСМ и нанопроводных детекторов.
  4. Методики определения размеров (3 нм – 1 мкм) частиц в растворах, в том числе биологических жидкостях.

Дополнительная информация доступна здесь

Оборудование

  • Атомно-силовые микроскопы NTEGRA (NT-MDT, Россия), Agilent 5500, Nanoscope IVa (Veeco);
  • Сканирующий электронный микроскоп S-5500 Hitachi;
  • Нанопроводной молекулярный детектор (совместно с ИФП СО РАН);
  • Лазерный корреляционный спектрометр N5 (Bruker Coulter);
  • Масс-спеткрометр Autoflex III (Bruker).

Публикации


Журнальные статьи

2014

  1. Иванов Ю.Д., Даничев В.В., Плешакова Т.О., Шумов И.Д., Зиборов В.С., Крохин Н.В., Загуменный М.Н., Устинов В.С., Смирнов Л.П., Широнин А.В., Арчаков А.И., Химический необратимый фишинг низкокопийных белков, Биомедицинская химия, 2014, том:60(1), стр:28-50. (Ivanov Yu.D., Danichev V.V., Pleshakova T.O., Shumov I.D., Ziborov V.S., Krokhin N.V., Zagumenniy M.N., Ustinov V.S., Smirnov L.P., Archakov A.I. Irreversible chemical AFM-based fishing for the detection of low-copied proteins. Biochemistry (Moscow) Suppl. Series B: Biomedical Chemistry. – 2013. – V. 7. – Issue 1. – P. 46-61. DOI: 10.1134/S1990750813010071)
  2. Bukharina N. S., Yu. D. Ivanov, T. O. Pleshakova, P. A. Frantsuzov, E. Yu. Andreeva, A. L. Kaysheva, A. A. Izotov, T. I. Pavlova, V. S. Ziborov, S. P. Radko, and A. I. Archakov, Atomic force microscopy fishing of gp120 on immobilized aptamers and its mass spectrometry identification, Bioсhemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry, 2014, vol:8(2), pages:115-124.
  3. Маlsagovа К.А., Ivanov Y.D., Pleshakova T.O., Kozlov A.F., Krokhin N.V., Kaysheva A.L., Shumov I.D., Popov V.P., Naumova O.V., Fomin B.I., Nasimov D.A. SOI-nanowire biosensor for detection of D-NFATc1 protein, Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry, 2014, vol:8(3), pages:220-225.
  4. Ivanov Y.D., Pleshakova T., Маlsagovа К., Kozlov A., Kaysheva A., Kopylov A., Izotov A., Andreeva E., Kanashenko S., Usanov S., Archakov A. Highly sensitive protein detection by combination of atomic force microscopy fishing with charge generation and mass spectrometry analysis, The FEBS Journal, 2014, vol:281(20), pages:4705-4717.
  5. Ivanov Y.D., Bukharina N.S., Pleshakova T.O., Frantsuzov P.A., Andreeva E.Yu., Kaysheva A.L., Zgoda V.G., Izotov A.A., Pavlova T.I., Ziborov V.S., Radko S.P., Moshkovskii S.A., Archakov A.I. Atomic force microscopy fishing and mass spectrometry identification of gp120 on immobilized aptamers, International Journal of Nanomedicine, 2014, vol:9, pages:4659-4670.
  6. Ivanov Y.D., Kaysheva A.L., Frantsuzov P.A., Pleshakova T.O., Krohin N.V., Izotov A.A., Shumov I.D., Uchaikin V.F., Konev V.A., Ziborov V.S., Archakov A.I. Detection of hepatitis C virus core protein in serum by atomic force microscopy combined with mass spectrometry, International Journal of Nanomedicine, 2014, In press.
  7. Yuri D. Ivanov, Tatyana O. Pleshakova, Vladimir P. Popov,Olga V. Naumova, Alexander L. Aseev and Alexander I. Archakov. SOI-Nanowire Biosensors for High-Sensitivity Protein and Gene Detection. In: Functional Nanomaterials and Devices for Electronics, Sensors and Energy Harvesting. A. Nazarov, F. Balestra, V. Kilchytska, D. Flandre (Eds.) Springer International Publishing Switzerland. (2014). pp. 445-467. DOI: 10.1007/978-3-319-08804-4_20

2013

  1. Иванов Ю.Д., Плешакова Т.О., Козлов А.Ф., Мальсагова К.А., Крохин Н.В., Кайшева А.Л., Шумов И.Д., Попов В.П., Наумова О.В., Фомин Б.И., Насимов Д.А., Асеев А.Л., Арчаков А.И. КНИ-нанопроволочный транзистор для детекции молекул D-NFATc1. Автометрия. – 2013. – Т. 49. – Вып. 5. – С.119-126. (Ivanov Yu.D., Pleshakova T.O., Kozlov A.F., Маl’sagovа К.А., Krohin N.V., Kaшsheva A.L., Shumov I.D., Popov V.P., Naumova O.V., Fomin B.I., Nasimov D.A., Aseev A.L., Archakov A.I. SOI nanowire transistor for detection of D-NFATc1 molecules. Optoelectronics, Instrumentation and Data Processing. – 2013. – V. 49. – Issue 5. – P. 520-525).
  2. Ivanov Yu.D., Pleshakova T.O., Krohin N.V., Kaysheva A.L., Usanov S.A., Archakov A.I. Registration of the protein with compact disc. Biosensors and Bioelectronics. 2013. V. 43. P. 384-390.

2012

  1. Yu. D. Ivanov, N. S. Bukharina, P. A. Frantsuzov, T. O. Pleshakova, N. V. Krohin, S. L. Kanashenko, A. I. Archakov. Oligomeric State Investigation of Flavocytochrome CYP102A1 using AFM with Standard and Supersharp Probes. Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry. 2012. V. 6. Issue 3. P: 218-224.
  2. Y. D. Ivanov, T. O. Pleshakova, A. F. Kozlov, K. A. Malsagova, N. V. Krohin, V. V. Shumyantseva, I. D. Shumov, V. P. Popov, O. V. Naumova, B. I. Fomin, D. A. Nasimov, A. L. Aseev, A. I. Archakov. SOI nanowire for the high-sensitive detection of HBsAg and a-fetoprotein. Lab on a Chip. 2012. V. 12. Issue 23. P. 5104-5111.
  3. Y. D. Ivanov, N. S. Bukharina, P. A. Frantsuzov, T. O. Pleshakova, S. L. Kanashenko, N. V. Medvedeva, V. V. Argentova, V. G. Zgoda, A. W. Munro, A. I. Archakov. AFM study of cytochrome CYP102A1 oligomeric state. Soft Matter. 2012. V. 8. Issue 17. P. 4602-4608.

2011

  1. Y.D. Ivanov, P.A. Frantsuzov, A. Zöllner, N.V. Medvedeva, A.I. Archakov, W. Reinle, R. Bernhardt. Atomic Force Microscopy Study of Protein–Protein Interactions in the Cytochrome CYP11A1 (P450scc)-Containing Steroid Hydroxylase System. Nanoscale Research Letters. 2011, V. 6, P. 54. doi:10.1007/s11671-010-9809-5.
  2. А.Л. Кайшева, Ю.Д. Иванов, П.А. Французов, Т.О. Плешакова, Н.В. Крохин, В.С. Зиборов, В.А. Конев, О.Б. Ковалев, А.И. Арчаков. Регистрация и идентификация НСVcore-содержащих вирусных частиц гепатита С с помощью комбинации атомно-силовой микроскопии и масс-спектрометрии. Нанотехнологии и охрана здоровья. 2011. Т. 3. С. 28-34.
  3. Ю.Д. Иванов, Н.С. Бухарина, Т.О. Плешакова, П.А. Французов, Н.В. Крохин, В.С. Зиборов, А.И. Арчаков. АСМ-визуализация, измерение активности и физико-химических свойств единичных мономеров и олигомеров ферментов. Биофизика. 2011. Т. 56. Вып. 5. С. 939-944.
  4. V. P. Popov, O. V. Naumova, Yu. D. Ivanov Semiconductor-on-insulator materials for nanoelectronics applications. Semiconductor-On-Insulator Materials For Nanoelectronics Applications. 2011. V. 4. P. 343-353.
  5. Archakov A.I. and Ivanov Yu.D. Application of AFM and optical biosensor for investigation of complexes formed in P450-containing monooxygenase systems. Biochimica et Biophysica Acta – Proteins and Proteomics, 2011, 1814, 102-110.

2010

  1. Yuri D. Ivanov, Pavel A. Frantsuzov, A. V. Ivanov, Victor A. Bykov, S. Besedin, Hui Bon Hoa, Alexander I. Archakov. Comparative investigation of PdR by usual and ultrafine atomic force microscopy Anal. Methods, 2010, 2, 688 – 693.
  2. АСН-нанотехнологии для визуализации, счета, определения упругости и активности единичных белков цитохром P450-содержащих монооксигеназных систем / Ю. Д. Иванов, Н.С. Бухарина, П.А. Французов, Т.О. Плешакова, А.В. Мунро, Г. Хуэй Бон Хоа, А.И. Арчаков Нанотехнологии и охрана здоровья. 2010. Т. 1. Вып. 2. С. 30-35.
  3. В.С. Зиборов, А.Л. Кайшева, Ю.Д. Иванов, В.Г. Згода, П.А. Французов, Т.О. Плешакова, Н.В. Крохин, А.И. Арчаков. Визуализация и идентификация вирусных частиц гепатита C при помощи атомно-силовой микроскопии, сопряженной с МС/МС анализом. Биомедицинская химия. 2010. Т. 56. Вып. 1. С. 26-39.
  4. А.В. Иванов, А.Т. Копылов, В.Г. Згода, И.Ю. Торопыгин, Е.В. Хряпова, Ю.Д. Иванов. Масс-спектрометрическая идентификация сайтов взаимодействия цитохрома P450 2В4 с NADPH:цитохром р450 редуктазой. Биомедицинская химия. 2010. Т. 56. Вып. 1. С. 40-54.
  5. O. V. Naumova, B. I. Fomin, D. A. Nasimov, N.V. Dudchenko, S.F. Devyatova, E.D. Zhanaev, V. P. Popov, A. V. Latyshev, A. L. Aseev, Yu. D. Ivanov, A. I. Archakov. SOI nanowires as sensors for charge detection. Semiconductor Science and Technology. 2010. V. 25. Issue 5. P. 055004.

2009

  1. Иванов Ю.Д., Иванов А.В., Кайшева А.Л., Згода В.Г., Уи Бон Уа Г., Усанов С.А., Арчаков А.И. Продуктивные и непродуктивные комплесы в цитохром P450-содержащих системах. Биомедицинская химия 2009, 55, 3, .310-330. (Productive and non-productive complexes in cytochrome p450-containing systems / Yu. D. Ivanov, A.V. Ivanov, A. L. Kaysheva, V. G. Zgoda, A. I. Archakov, S. A. Usanov, G. Hui-Bon-Hoa // Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry. 2009. V. 3. P. 183-197.)
  2. Archakov A.I., Ivanov Y.D., Lisitsa A.V., Zgoda V.G. Biospecific irreversible fishing coupled with atomic force microscopy for detection of extremely low-abundant proteins. Proteomics. 2009, 9, 5, 1326-1343.
  3. Ю.Д. Иванов, П.А. Французов, Т.О. Плешакова, В.С Зиборов, С.К. Светлов, Н.В. Крохин, В.А. Конев, О.Б. Ковалев, В.Ф. Учайкин, О.Н. Ястребова, П. Г. Свешников, А.И. Арчаков. Детекция серологических маркеров вирусных гепатитов В и С методом атомно-силовой микроскопии.// Биомедицинская химия, 2009, 55 689-701, Yu.D. Ivanov, P.A.Frantsuzov, T.O. Pleshakova ,V.S. Ziborov, S.K. Svetlov, N.I. Krohin. V.A. Konev, O.B. Kovalev, V.F. Uchaikin, O.N. Yastrebova, P.G. Sveshnikov, A.I. Archakov. Atomic Force Microscopy of Serological Markers of Viral Hepatites B and C. Biomeditsinkaya Khimiya, 55 (2009) 689-701
  4. O. V. Naumova, V. P. Popov, L. N. Safronov, B. I. Fomin, D. A. Nasimov, A. V. Latysheva, A. L. Aseev, Yu. D. Ivanov and A. I. Archakov. Ultra-Thin SOI Layer Nanostructuring and Nanowire Transistor Formation for FemtoMole Electronic Biosensors. ECS Transactions, 25 (10) 83-87 (2009) 10.1149/1.3241580

2008

  1. Иванов Ю.Д., Иванов А.В., Петушкова Н.А., Гара О.Г.. Кузнецов В.Ю., Подоплелов А.В., Арчаков А.И. Оптико-биосенсорный анализ взаимодействий редокс-партнеров цитохром Р450 2В4 – содержащей монооксидазной системы в условиях гидроксилирования. Биомедицинская химия, 2008, 54, 435-444. (The optical biosensor study of the redox partner interaction with the cytochrome p450 2b4-containing monooxygenase system under hydroxylation conditions / Yu. D. Ivanov, A. V. Ivanov, N. A. Petushkova, O. G. Gara, V. Yu. Kuznetsov, A. V. Podoplelov, A. I. Archakov // Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry. 2008. V. 2. Issue 4. P. 367-372.)

2007

  1. Archakov A.I., Ivanov Yu.D. Analytical nanobiotechnology for medicine diagnostics. Molecular Biosystems, 2007, 3, 336-342.
  2. Medvedeva N.V., Ipatova O.P., Ivanov Yu.D., Drozhzhin A.I. and Archakov A.I. Nanobiotechnology and Nanomedicine. Biomedical Chemistry, 2007, 1, 2, 114-124.
  3. Archakov A.I., Ivanov Y.D., Lisitsa A.V., Zgoda V.G. AFM fishing nanotechnology is the way to reverse the Avogadro number in proteomics. Proteomics, 2007, 7, 4–9.

2006

  1. Medvedev A., Buneeva O., Gnedenko O., Fedchenko V., Medvedeva M., Ivanov Y., Glover V., Sandler M. Isotin interaction with glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, a putative target of neuroprotective drugs: partial agonism with deprenyl. J. Neural Transm, 2006, 71, 97-103.
  2. Ivanov Yu.D., Govorun V.M., Bykov V.A. and Archakov A.I. Nanotechnology in Proteomics, Proteomics, 2006, 6, 1399-1414.
  3. Медведева Н. В., Ипатова О.М., Иванов Ю.Д., Дрожжин А.И., Арчаков А.И. Нанобиотехнология и наномедицина, Биомедицинская химия, 2006, 52, 6, 529-546.
  4. Арчаков А.И., Иванов Ю.Д. Аналитические нанотехнологии в диагностической протеомике. Сборник материалов XIX(82) сессии общего собрания Российской Академии Медицинских Наук,.
  5. Иванов Ю.Д., Учайкин В.Ф., Плешакова Т.О., Французов П.А., Светлов С.К., Конев В.А., Ковалев О.Б., Ястребова О.Н., Свешников П.Г., Уланова Т.И., Арчаков А.И. Создание нового поколения био-и иммуносенсоров и биочипов для диагностики инфекционных и неинфекционных заболеваний. Физиология и патология иммунной системы, 2006, 12, 10, 11-14.

2005

  1. Раченкова Н.И., Иванов Ю.Д., Скворцов В.С., Иванов А.С., Молнар А.А., Уи Бон Уа Г., Арчаков А.И. Исследование взаимодействия цитохромов b5 с Р450CAM с помощью метода оптического биосенсора и компьютерного моделирования. Биомедицинская химия, 2005, 51, 501-512.
  2. Archakov A.I., Inanov Yu.D. Nano(Bio)Technology for Medicine in Russia. Proceedings of EuroNanoForum 2005 (Nanotechnology and the Health of the EU Citizen in 2020), 201-208.
  3. Раченкова Н.И., Иванов Ю.Д., Мольнар А.А., Арчаков А.И. Исследования взаимодействия трипсина с соевым ингибитором трипсина с помощью метода оптического биосенсора. Биомедицинская химия, 2005, 51, 6, 614-623.

2004

  1. Kuznetsov V.Yu., Ivanov Yu.D., Archakov A.I. Atomic force microscopy revelation of molecular complexes in the multiprotein cytochrome P450 2B4-containing system. Proteomics, 2004, 4, 2390-2396.
  2. Арчаков А.И., Иванов Ю.Д., Ипатова О.М. Нанобиотехнология в протеомике и медицине. Сборник материалов ХIV (LXXVII) сессии общего собрания Российской академии медицинских наук, посвященной 60-летию Академии медицинских наук. Научные основы охраны здоровья детей. 2004, 56-62.
  3. Shumyantseva V.V., Ivanov Yu.D., Bistolas N., Scheller F.W., Archakov A.I., Wollenberger U. Direct electron transfer of cytochrome P450 2B4 at electrodes modified withnon-ionic detergent and colloidal clay nanoparticles. Analytical Chemistry, 2004, 76, 6046-6052.

2003

  1. Арчаков А.И., Иванов Ю.Д., Говорун В.М., Учайкин В.Ф., Николаева Л.И., Гнеденко О.В., Константинова Н.И., Ковалев А.В., Конев В.А. Разработка новых методов диагностики гепатитов В и С. Аллергия, астма и иммунология, 2003, 9, 175-178.
  2. Иванов Ю.Д., Гнеденко О.В., Николаева Л.И., Конев В.А., Ковалев О.Б., Учайкин В.Ф., Говорун В.М., Покровский В.И., Арчаков А.И. Определение поверхностного антигена вируса гепатита В с помощью оптического биосенсора. Журн. микробиол., 2003, 2, 58-62.
  3. Archakov A.I., Govorun V.M., Dubanov A.V., Ivanov Yu.D., Veselovsky A.V., Lewi P., Janssen P. Protein-protein interactions as a target for drugs in proteomics. Proteomics, 2003, 3, 380-391.
  4. Momynaliev K.T., Govorun V.M., Gnedenko O., Ivanov Yu.D., Archakov A.I. The use of the resonant mirror biosensor to detect point mutations, as demonstrated with synthetic oligonucleotides. J. of Mol Recognition, 2003, 16, 1-8.
  5. Бунеева О.А., Гнеденко О.В., Панова Н.Г., Медведева М.В., Иванов Ю.Д., Медведев А.Е. Глицерол-3-фосфатдегидрогеназа-изатин-связывающий белок цитозоля. Биомедицинская химия, 2003, 49, 6, 627-631.

2002

  1. Kuznetsov V.Yu., Ivanov Yu.D., Bykov V.A., Saunin S.A., Fedorov I.A., Lemeshko S.V., Hui Bon Hoa and Archakov A.I. Atomic force microscopy detection of molecular complexes in multiprotein P450cam-containing monooxygenase system. Proteomics, 2002, 2, 1699-1705.
  2. Иванов Ю.Д., Панова Н.Г., Гнеденко О.В., Бунеева О.А., Медведев А.Е., Арчаков А.И. Исследование тканевого и субклеточного распределения изатин-связывающих белков при помощи оптического биосенсора. Вопросы мед. химии, 2002, 48, 1, 73-83.
  3. Дмитриев Д.А., Массино Ю.С., Сегал О.Л., Смирнова М.Б., Павлова Е.В., Коляскина Г.И., Гуревич К.Г., Гнеденко О.В., Иванов Ю.Д., Арчаков А.И., Осипов А.П., Дмитриев А.Д., Егоров А.М. Анализ связывания биспецифических моноклональных антител с иммобилизованными антигенами с помощью оптического биосенсора. Биохимия, 2002, 67, 12, 1643-1654.
  4. Dmitriev D.A., Massino Y.S., Segal O.L., Smirnova M.B., Pavlova E.V., Gurevich K.G., Gnedenko O.V., Ivanov Y.D., Kolyaskina G.I., Archakov A.I., Osipov A.P., Dmitriev A.D., Egorov A.M. Analysis of the binding of bispecific monoclonal antibodies with immobilized antigens (human IgG and horseradish peroxidase) using a resonant mirror biosensor. J Immunol Methods, 2002, 261, 103-118.
  5. Archakov A.I., Ivanov Y.D. Optical biosensor and scanning probe microscopy studies of cytochrome P450 interactions with redox partners and phospholipid layers. Methods in Enzymology, 2002, 357, 94-103.
  6. Veselovsky A.V., Ivanov Yu.D., Ivanov A.S., Archakov A.I., Lewi P., Janssen P. Protein-protein interactions: mechanisms and modification by drugs. J. of Mol. Recognition, 2002, 15, 405-422.

2001

  1. Ivanov Yu.D., Kanaeva I.P., Karuzina I.P., Archakov A.I., Hui Bon Hoa G., Sligar S.G. Molecular recognition in the P450cam Monooxygenase System: direct monitoring of Protein-Protein Interaction by using optical biosensor. Arch. Biochem. Biophys, 2001, 391, 255-264.
  2. Ivanov Yu.D., Kanaeva I.P., Karyzina I.I., Usanov S.A., Hui Bon Hoa G., Sligar S.G. and Archakov A. I. Revelation of ternary complexes between redox partners in cytochrome P450-containing monooxygenase systems by the optical biosensor method. J. of Inorg. Biochem. 2001, 87, 175-184.
  3. Ivanov Yu.D., Kanaeva I.P., Gnedenko O.V., Pozdnev V.F., Shumyantseva V.V., Samenkova N.F., Kuznetsova G.P., Tereza A.M., Schmid R.D., Archakov A.I. Optical Biosensor investigation of interactions of biomembrane and water–soluble cytochromes P450 and their redox partners with covalently immobilized phosphatidylethanolamine layers. J. Molec. Recognition, 2001, 14, 185-196.
  4. Семенова Н.В., Иванов Ю.Д., Гнеденко О.В., Конев В.А., Ковалев О.Б., Учайкин В.Ф., Морозов С.Г., Арчаков А.И. Диагностика инфекционных заболеваний с помощью оптического биосенсора. Выявление поверхностного антигена вируса гепатита В (HBsAg) методом оптического биосенсора. Новости науки и техники. Аллергия, астма и клиническая иммунология. 2001, 1, 183-185.
  5. Иванов Ю.Д., Гнеденко О.В., Конев В.А., Ковалев О.Б., Николаева Л.И., Семенова Н.В., Учайкин В.Ф., Арчаков А.И. Детекция поверхностного антигена вируса гепатита В с помощью оптического биосенсора. Вопросы мед. химии, 2001, 47, 4, 419-425.

2000

  1. Ivanov Yu.D., Kanaeva I.P. and Archakov A.I. Optical biosensor study of ternary complex formation in a cytochrome P450 2B4 system. Biochemical and Biophysical Research Communications, 2000, 273, 750-752.

1999

  1. Ivanov Yu.D., Kanaeva I.P., Kuznetsov V.Yu., Lehnerer M., Schulze J., Hlavica P., and Archakov A. I. The optical biosensor studies on the role of hydrophobic tails of NADPH-cytochrome P450 reductase and cytochromes P450 2B4 and b5 upon productive complex formation within a monomeric reconstituted system. Arch. Biochem. Biophys. 1999, 362, 1, 87-93.
  2. Ivanov Yu.D., Usanov S.A. and Archakov A.I. Optical biosensor studies on the productive complex formation between the components of cytochrome P450scc dependent monooxygenase system. Biochemistry and Molecular Biology International. 1999, 47, 2, 327-336.
  3. Koudinov A.R., Koudinova N.V., Berezov T.T., Ivanov Y.D. HDL phospholipid: a natural inhibitor of Alzheimer’s amyloid beta-fibrillogenesis? Clin Chem Lab Med. 1999, 37 (9), 993-994.
  4. Koval V.V., Gnedenko O.V., Ivanov Yu.D., Fedorova O.S., Archakov A.I., Knorre D.G. Real — time oligonucleotide hybridization kinetics monitored by resonant mirror technique. IUBMB LIFE, 1999, 48, 317-320.
  5. Kiselyova O.I., Yaminsky I.V., Ivanov Yu.D., Kanaeva I.P., Kuznetsov V.Yu., Archakov A.I. AFM study of membrane proteins, cytochrome P450 2B4 and NADPH-cytochrome P450 reductase, and of their complex formation. Archives of Biochemistry and Biophysics, 1999, 371, 1, 1-7.
  6. Морозов С.Г., Иванов Ю.Д., Учайкин В.Ф., Каражас Н.В., Вахрушина С.В., Гнеденко О.В., Конев В.А., Ковалев О.Б., Арчаков А.И. Диагностика Цитомегаловирусной инфекции с помощью оптического биосенсора. Аллергия, астма и клиническая иммунология, 1999, 9, 187-189.

1998

  1. Archakov A.I. and Ivanov Yu.D. The optical biosensor study of protein-protein interactions within cytochromes P450 containing mononoxygenase systems. In Book Biophysics of Electron Transfer and Molecular Bioelectronics. Plenum Press, USA, 1998, 173-196.

1997

  1. Ivanov Yu. D., Kanaeva I.P., Eldarov M.A., Skryabin K.G., Lehnerer M., Schulze J., Hlavica P., and Archakov A.I. An optical biosensor study of the parameters and role of hydrophobic tails of cytochrome P450 cytochromes.P4502B4, b5 and NADPH-flavoprotein in complex. Biochemistry and Molecular Biology International. 1997, 42, 4, 731-737.

1995

  1. Shumyantseva V.V., Meshkov S.V., Ivanov Yu. D., Alexsandrova O.V., Uvarov V. Yu. and Archakov A.I. Interaction of organophosphorus analogues of amino acids whith P 450. Xenobiotica, 1995, 25, 3, 219-227.

1993

  1. Ivanov Yu.D., Makarov S.G. and Uvarov V.Yu. Resolution of overlapped spectral bands by the Monte Carlo metod. Vibrational Spectroscopy,1993, 5, 175-179.

Патенты

  1. Патент N 2315999 от 27 01 2008 бюллетень № 3 Арчаков А.И., Говорун В.М., Гнеденко А.И. Иванов Ю.Д. и др. Нанодиагностическая тест – система для выявления вирусов гепатитов.
  2. Пат. 2283496 Российская Федерация, МПК G01N33/53, G01N13/10. Способ регистрации макромолекул при проведении протеомных исследований и биочип, используемый при их регистрации [Текст] / Арчаков А. И., Иванов Ю. Д., Говорун В. М., Быков В. А., Светлов С. К., Позднеев В. Ф.,Зиборов В. С.,Кирпичников М. П.; заявитель и патентообладатель Арчаков А.И. (RU). № 2004119864/15; заявл. 30.06.2004; опубл. 10.01.2006
  3. Пат. 2338199 Российская Федерация, МПК G01N33/543. Способ регистрацииспецифических макромолекул в биологической пробе и устройство для его осуществления [Текст] / Арчаков А. И., Иванов Ю. Д., Плешакова Т.О., Светлов С. К., Крохин Н. В., Быков В. А.; заявитель и патентообладатель Арчаков А.И. (RU). № 2006124680/15; заявл. 11.07.2006; опубл. 20.01.2008
  4. Пат. 2351932 Российская Федерация, МПК G01N33/53. Способ регистрации и идентификации макромолекул при помощи сопряженной системы на основе сканирующей пробной микроскопии и масс-спектрометрии [Текст] / Арчаков А. И., Иванов Ю. Д., Плешакова Т. О., Торопыгин И. Ю., Згода В. Г., Быков В. А.; заявитель и патентообладатель Арчаков А.И. (RU). № 2006129865/15; заявл. 18.08.2006; опубл. 27.02.2008
  5. Пат. 2361215 Российская Федерация, МПК G01N33/53. Диагностическая тест-система для выцявления заболевания [Текст] / Арчаков А. И., Иванов Ю. Д., Быков В. А.; заявители и патентообладатели Арчаков А.И. (RU), Иванов Ю. Д. (RU). № 2007141809/15; заявл. 14.11.2007; опубл. 14.11.2007
  6. Пат. 2362169 Российская Федерация, МПК G01N33/543.Нанобиочип, используемый для регистрации белков и белковых комплексов, способ его получения и способ регистрации белков и белковых комплексов с использованием зондовой микроскопии, [Текст] / Арчаков А. И., Иванов Ю. Д., Плешакова Т.О., Светлов С. К., Быков В. А., Зиборов В. С.; заявитель и патентообладатель Арчаков А.И. (RU). № 2007117787/15; заявл. 14.05.2007; опубл. 20.11.2008
  7. Свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ № 2013614266 Российская Федерация. Программное обеспечение НАНОБИОСЕНСОР (ПО НБС) / Авторы: Арчаков А. И., Иванов Ю. Д., Крохин Н. В., Козлов А. Ф.; патентообладатель: Федеральное государственное бюджетное учреждение «Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н.Ореховича» Российской академии медицинских наук. Заявка № 2013610110, дата поступл. 10.01.2013, зарегистрирована в реестре программ для ЭВМ 26.04.2013
  8. Свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ № 2010613458 Российская Федерация. Программное обеспечение обработки данных АСМ (ПО одАСМ) / Авторы: Крохин Н. В., Арчаков А. И., Иванов Ю. Д., Плешакова Т. О., Бухарина Н. С.; правообладатель: Крохин Николай Валентинович. Заявка № 2010611728, дата поступл. 06.04.2010, зарегистрирована в реестре программ для ЭВМ 26.05.2010

Партнеры

ПАРТНЕРЫ

  • Dr. Gaston Hui Bon Hoa, INSERM, Paris, France.
  • Prof. R. Bernhardt, Institute of Biochemistry Saarland University, Saarbrucken, Germany.
  • Проф. Усанов С.А., Институт биоорганической химии, Минск, Беларусь.
  • Институт физики полупроводников СО РАН (ИФП СО РАН), Новосибирск
    ИФП СО РАН является исследовательским центром с широким фронтом деятельности в области современной физики полупроводников, физики конденсированного состояния, в развитии научных основ технологий полупроводниковой микро-, опто-, нано- и акустоэлектроники, информационных технологий и квантовой электроники.
  • НТ-МДТ
    Специализируется на создании прецизионной нанотехники, в том числе производит устройства сопряжения АСМ с рамановскими спектрометрами, с масс-спектрометрами и т.д. Производственная база и инженерные кадры НТ-МДТ позволяют на должном уровне провести необходимые конструкторские разработки. НТ-МДТ является признанным лидером на отечественном рынке по производству сканирующих зондовых микроскопов (СЗМ), в том числе АСМ.
  • Interlab Inc. (Agilent Technologies)
    Одна из наиболее динамичных и быстро развивающихся компаний на рынке аналитического оборудования, поддерживающая крупные государственные программы в области здравоохранения.