Лаборатория медицинской биотехнологии

Статистика научной деятельности


О лаборатории

Лаборатория создана в 1989 году
Зав. лабораторией — д.б.н., профессор Соколов Николай Николаевич
Штат лаборатории — 9 сотрудников и 2 лаборанта-исследователя.
Расположение — ФГБНУ «ИБМХ», корпус «7», этаж 5, комнаты 551, 552, 553, 559, 560, 561, 351.
Тел.: +7 (499) 246-33-80; +7 (499) 245-05-09

ОСНОВНЫЕ НАУЧНЫЕ НАПРАВЛЕНИЯ:

  • Исследование бактериальных L-аспарагиназ:
    — Создание штаммов-продуцентов бактериальных L-аспарагиназ, а также мутантных форм L-аспарагиназ, оптимизация их экспрессии и очистки, изучение энзимологических и биологических свойств и получение биоконъюгатов аспарагиназ.
    — Исследование антипролиферативной активности L-аспарагиназ и их модифицированных производных.
  • Изучение функционирования теломеразы в опухолевых и нормальных клетках.
  • Разработка нового биотехнологического подхода создания уникальных «полипептидных кассет» для балансирования рационов сельскохозяйственной птицы по ключевым аминокислотам.

Учебно-научная работа

Студенты ряда московских ВУЗов (РНИМУ им. Н.И. Пирогова, МИТХТ, РУДН, РХТУ им. Д.И. Менделеева, МГМУ им. И.М. Сеченова) проходят дипломную практику на базе лаборатории. Лучшие из выпускников продолжают учебу в аспирантуре Российской академии медицинских наук по специальности «Биохимия».

Дипломные работы, выполненные на базе Лаборатории

Сотрудники


Проекты


Текущие проекты

  1. «Полипептидные кассеты» для балансирования рационов по ключевым аминокислотам в птицеводстве (Грант РНФ № 16-16-04086 2016-2018гг.)
  2. «Исследование связи структуры и функций L-аспарагиназы из Rhodospirillum rubrum методом сайт-направленного мутагенеза» (Проект РФФИ № 15-34-70020 мол_а_мос 2016-2017 гг.)

Завершенные проекты

  1. Поиск молекулярной мишени и оценка фармакологического потенциала биосинтетических предшественников и метаболитов брассиностероидов в клетках карциномы простаты в качестве новых перспективных противоопухолевых препаратов (Грант РФФИ, № 15-04-99711).
  2. Регуляция каталитических свойств рекомбинантной l-аспарагиназы Еrwinia carotovora с использованием со-полимеров ПЭГ-хитозана (Грант РФФИ, № 14-04-00325).
  3. Разработка экспериментально-производственной технологии получения субстанции, создание образцов лекарственной формы, доклинические испытания субстанции, структурно-функциональное изучение и получение модифицированных форм с улучшенными фармакологическими свойствами рекомбинантной L-аспарагиназы Erwinia carotovora (Грант МНТЦ №2828) (2000- 2003 гг.).
  4. Создание штамма-продуцента рекомбинантной L-аспарагиназы Erwinia carotovora и разработка крупномасштабного способа очистки фермента с высокой противоопухолевой активностью. (Грант МНТЦ №1263)
    (2005-2011 гг.).
  5. Молекулярная основа лекарственной устойчивости клеток лейкозов человека к бактериальной L-аспарагиназе (Грант РФФИ, № 06-04-49792) (2006-2008 гг.).
  6. Новые бактериальные L-аспарагиназы: изучение структурно-функционального разнообразия ферментов и получение аналогов с улучшенными фармакологическими свойствами» (Грант РФФИ, № 04-04-49085а.) (2004-2006 гг.).
  7. Эпитопное картирование L-аспарагиназы и получение рекомбинантных гипоаллергенных форм фермента. (Грант РФФИ, №02-04-49002а) (2002-2004 гг.).
  8. Поиск и анализ мимотопов и пептидомиметиков инсулина. (Грант РФФИ, № 99-04-48544) (1999-2001 гг.).
  9. Разработка подходов к локо-региональной терапии злокачественных опухолей человека с помощью активации противоопухолевых препаратов генетическими конструкциями, экспрессирующими цитохромы семейства Р450 (Грант Миннауки в рамках Проекта 05 «Генодиагностика и генотерапия социально значимых заболеваний человека».) (1999-2001 гг.).
  10. Создание биокаталитических и аналитических устройств на основе полу-искусственных и рекомбинантных цитохромов для мониторинга лекарств и изучения синтеза стероидов. (Грант INCO-Copernicus №ERB3512PL965070 (контракт №ERBIC15CT960810)) (1997-1999 гг.).
  11. Создание штамма-продуцента рекомбинантной L-аспарагиназы Erwinia carotovora. (Грант Миннауки в рамках Программы «Новейшие методы биоинженерии») (1999-2000 гг.).

Результаты

РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ И РАЗРАБОТОК

  • Созданы генно-инженерные продуценты бактериальных L-аспарагиназ, (Erwinia carotovora, Yersinia pseudotuberculosis, Helicobacter pylori, Achromobacter sp., Rhodospirillum rubrum), разработаны способы очистки этих ферментов с высоким выходом в близком к гомогенному состоянии. Исследованы физико-химические, каталитические и структурные свойства этих ферментов.
  • Выделена и охарактеризована рекомбинантная L-аспарагиназа RrA (R. rubrum), имеющая низкую гомологию с EcA и EwA, Фермент является первой цитоплазматической L-аспарагиназой I типа, обладающей антипролиферативной активностью, свойственной, как считалось ранее, только периплазматическим аспарагиназам II типа. RrA обладает потенциалом для использования в заместительной терапии лейкоза в случае развития гиперчувствительности к L-аспарагиназам.
  • С целью идентификации функционально важных районов молекулы рекомбинантной L-аспарагиназы R. rubrum (RrA) и перспективой улучшения её терапевтических свойств методом сайт-направленныого мутагенеза получено 10 многоточечных мутантных форм фермента, 5 из которых выделено в функционально-активном высокоочищенном состоянии. Предполагается, что для энзиматической активности RrA важное значение имеют аминокислотные остатки L-треонина, L-фенилаланина, L-серина и L-тирозина.
  • Показано, что ряд мутантных форм RrA снижают экспрессию hTERT субъединицы теломеразы и, следовательно, активность теломеразы в клетках Jurkat, но не в клеточных лизатах. В тоже время, L-аспарагиназ E. coli (EcA), Er. carotovora (EwA) и W. succinogenes (WsA) не подавляют активность теломеразы. Предполагается существование в структуре RrA областей (аминокислотные остатки 146-164, 1-17, 60-67), отвечающих за подавление теломеразной активности. Полученные результаты показывают, что противоопухолевая активность некоторых вариантов RrA связана как с уменьшением концентрации свободного L-аспарагина, так и с угнетением экспрессии hTERT субьединицы теломеразы, что открывает новые перспективы для противоопухолевой терапии.
  • Создана лекарственная инъекционная форма рекомбинантной L-аспарагиназы E. carotovora (совместно с ЗАО БиоХимМак «СТ» и ЗАО «Биокад»). Доклиническое изучение лекарственной формы свидетельствуют о перспективности ее клинического применения в химиотерапии лейкозов.
  • Получены модифицированные полиэтиленгликолем и хитозаном препараты рекомбинантных L-аспарагиназ EwA и RrA, обладающих антипролиферативным действием.
  • Выявлена способность эндонуклеазы EndoG индуцировать экспрессию различных апоптотических нуклеаз. EndoG способна вызывать альтернативный сплайсинг каталитической субъединицы теломеразы hTERT, что приводит к ингибированию активности теломеразы. Длительное культивирование опухолевых клеток с неактивной теломеразой приводит к укорочению их теломер до критических значений и гибели клеток. Показано, что благодаря РНКазной активности EndoG способна производить активный РНК-олигонуклеотид, который взаимодействуя с мРНК hTERT, индуцирует альтернативный сплайсинг.

Оборудование

  • Спектрофотометр Aquarius (Англия)
  • Мультискан Lab System (Финляндия)
  • Центрифуги Beckman Coulter: Optima L-90K, LE-80K, TJ-6R, J-25, J2-21(США)
  • Ферментер BIOFLO 110 New Brunswick Scientific (США)
  • Термостаты с качалками для микробиологии Gerhardt (Германия)
  • Ламинарный шкаф Faster BH 2003 , Heraguard Heraeus (Германия)
  • ДНК-лаборатория (PCR-амплификаторы, микроцентрифуги, приборы для белкового и ДНК гель-электрофореза) Eppendorf (Германия), Bio-Rad (США)
  • Оборудование для колоночной хроматографии (холодильные камеры, колонки, коллекторы фракций, насосы перистальтические Gilson (Франция), Pharmacia (Швеция).
  • Бокс абактериальной воздушной среды БАВ-ПЦР-«Ламинар-С»
  • ДНК-амплификатор детектирующий «ДТлайт»
  • ДНК-амплификатор в «реальном времени» «ДТпрайм» в комплекте с управляющим компъютером с Ippon innova RT 2000VA, Nippon Klick Corporation.
  • Электропоратор MicroPulser Electroporator
  • Термостат программирующий для проведения ПЦР анализа, 4-канальный ТП4-ПЦР-01-«Терцик

Публикации


Журнальные статьи

2017

  1. Жданов Д.Д., Васина Д.А., Орлова Е.В., Орлова В.С., Покровский В.С., Покровская М.В., Александрова С.С., Соколов Н.Н., Индуцированная цисплатином экспрессия апоптотической эндонуклеазы EndoG вызывает ингибирование активности теломеразы и злокачественную трансформацию CD4+ Т-лимфоцитов человека, Биомедицинская химия, 2017, 63(1), 13-26
  2. Покровская M.В., Жданов Д.Д., Эльдаров М.А., Aлександрова С.С., Веселовский А.В., Покровский В.С., Гришин Д.В., Гладилина Ю.А., Соколов Н.Н., Подавление активности теломеразы лейкозных клеток мутантыми формами L-аспарагиназы Rhodospirillum rubrum, Биомедицинская химия, 2017, 63(1), 62-74
  3. Гришин Д.В., Покровская М.В., Подобед О.В., Гладилина Ю.А., Покровский В.С., Александрова С.С., Соколов Н.Н., Прогнозирование термостабильности белков по их первичной структуре: современное состояние и факторы развития, Биомедицинская химия, 2017, 63(2), 124-131
  4. Morozova E.A., Anufrieva N.V., Davydov D.Zh., Komarova M.V., Dyakov I.N.,. Rodionov A.N., Demidkina T.V., Pokrovsky V.S., Plasma methionine depletion and pharmacokinetic properties in mice of methionine γ-lyase from Citrobacter freundii, Clostridium tetani and Clostridium sporogenes, Biomedicine & Pharmacotherapy, 2017, 88, 978-984
  5. Vasina D.A., Zhdanov D.D., Orlova E.V., Orlova V.S., Pokrovskaya M.V., Aleksandrova S. S., and Sokolov N. N. Apoptotic Endonuclease EndoG Inhibits Telomerase Activity and Induces Malignant Transformation of Human CD4+ T Cells. Biochemistry (Moscow), 2017, 82(1):24-37.
  6. Васина Д.А., Жданов Д.Д., Орлова Е.В., Орлова В.С., Покровская М.В., Александрова С.С., Соколов Н.Н. Апоптотическая эндонуклеаза endog вызывает ингибирование активности теломеразы и злокачественную трансформацию CD4+Т клеток человека. Биохимия, 2017, (82)(1):76 – 91.
  7. Жданов Д.Д., Лохонина А.В., Соколов Н.Н. Роль сплайс-вариантов аталитической субъединицы теломеразы человека hTERT в физиологических и патологических клеточных процессах. Молекулярная медицина 2017, 15, (1):3-10.
  8. Мелик-Нубаров Н.С., Гроздова И.Д., Ломакина Г.Ю., Покровская М.В., Покровский В.С., Александрова С.С., Абакумова О.Ю., Подобед О.В., Гришин Д.В., Соколов Н.Н. Пэгилированная рекомбинантная l-аспарагиназа Еrwinia carotovora: получение, свойства и перспективы использования. Прикл. биохимия и микробиол. 2017, 52(2):164-172.

2016

  1. Sukhoverkov K.V., Sokolov N.N., Abakumova O.J., Podobed A.A., Kudryashova E.V., The formation of conjugates with PEG–Chitosan improves the biocatalytic efficiency and antitumor activity of L-asparaginase from Erwinia carotovora, Moscow University Chemistry Bulletin, 2016, 71(2), 1-5
  2. Pokrovsky V.S., Kazanov M.D., Dyakov I.N., Pokrovskaya M.V., Aleksandrova S.S., Comparative immunogenicity and structural analysis of epitopes of different bacterial L-asparaginases, BMC Cancer, 2016, том:16(1), стр:89
  3. Суховерков К.В., Абакумова О.Ю., Подобед О.В., Соколов Н.Н., Кудряшова Е.В. Увеличение каталитической эффективности и противоопухолевой активности рекомбинантной l-аспарагиназы Еrwinia сarotovora при образовании конъюгатов с сополимерами пэг-хитозана. // Вестн. моск. ун-та. сер. 2. химия. 2016. Т. 57. № 2, С. 30-36.
  4. Жданов Д.Д., Васина Д.А., Орлова В.С., Готовцева В.Ю., Бибикова М.В., Покровский В.С., Покровская М.В., Александрова С.С., Соколов Н.Н. «Эндонуклеаза EndoG индуцирует альтернативный сплайсинг каталитической субъединицы теломеразы hTERT и гибель опухолевых клеток», Биомедицинская химия, 2016, Т. 62, №3, С. 239-250.
  5. Д.Д. Жданов, Д.А. Васина, Е.В. Орлова, В.С. Орлова, М.В. Покровская, С.С. Александрова, Н.Н. Соколов. «Регуляция альтернативного сплайсинга каталитической субъединицы теломеразы hTERT апоптотической эндонуклеазой EndoG» Биомедицинская химия. Т. 62, вып. 5, С. 544-554. DOI 10.18097/PBMC20166205544.

2015

  1. Pokrovskaya M.V. , Aleksandrova S.S. , Pokrovsky V.S. , Veselovsky A.V. , Grishin D.V. , Abakumova O.Y. , Podobed O.V. , Mishin A.A. , Zhdanov D.D. , Sokolov N.N., Identification of Functional Regions in the Rhodospirillum rubrum l-Asparaginase by Site-Directed Mutagenesis, Molecular Biotechnology, 2015, том:57(3), стр:251-264
  2. Zhdanov D., Fahmi T., Wang X., Apostolov Y., Sokolov N.N., Javaqdov S., Basnakian A., Regulation of apoptotic endonucleases by EndoG, DNA and Cell Biology, 2015, том:57(3), стр:251-264
  3. Гришин Д.В., Соколов Н.Н., Рекомбинантные эластомерные белки как основа для создания новых тканеинженерных матриксов, Известия вузов. Прикладная химия и биотехнология, 2015, том:2(13), стр:24-37
  4. Соколов Н.Н., Эльдаров М.А., Покровская М.В., Александрова С.С., Абакумова О.Ю., Подобед О.В., Мелик-Нубаров Н.С., Кудряшова Е.В., Гришин Д.В., Арчаков А.И., Бактериальные рекомбинантные L-аспарагиназы: свойства, строение и антипролиферативная активность, Биомедицинская химия, 2015, том:61(3), стр:312-324
  5. Кудряшова Е.В., Суховерков К.В., Соколов Н.Н., Применение сополимеров ПЭГ-хитозана для регуляции каталитических свойств ферментных препаратов медицинского назначения на примере рекомбинантной L-аспарагиназы erwinia carotovora, Биомедицинская химия, 2015, том: 61(4), стр:480-487

2014

  1. Grishin D.V., Sokolov N.N., Defensins are natural peptide antibiotics of higher eukaryotes, Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry, 2014, том:8(1), стр:11-18
  2. Гришин Д.В., Соколов Н.Н., Дефензины – естественные пептидные антибиотики высших эукариот, Биомедицинская химия, 2014, том:60(4), стр:438-447
  3. Kudryashova E.V., Sukhoverkov K.V., Sokolov N.N., Application of PEG-chitosan copolymers for regulation of catalytic properties of enzymes for medical application using recombinant Erwinia carotovora L-asparaginase as an example, Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry, 2014, том:8(3), стр:252-259
  4. Дьяков И.Н., Покровский В.С., Санникова Е.П., Булушова Н.В., Покровская М.В., Александрова С.С., Перекрестная иммуногенность различных бактериальных L-аспарагиназ, Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии, 2014, том:(6), стр:100-104
  5. Shalak V.F., Vislovukh A.A., Novosylna O.V., Khoruzhenko A.I., Kovalenko M.I., Kolesanova E.F., Egorova E.A. , Mishin A.A., Krotevych M.S., Skoroda L.V., Negrutskii B.S., Characterization of novel peptide-specific antibodies against the translation elongation factor eEF1A2 and their application for cancer research, Biopolymers and Cell, 2014, том:30(6), стр:454-461

2013

  1. О.Ю. Абакумова, О.В. Подобед, П.А. Каралкин, Л.И. Кондакова и Н.Н. Соколов. Противоопухолевая активность L-аспарагиназы Erwinia сarotovora для клеток различных лейкемий человека и солидных опухолей человека и животных. Биомед. химия (2013) 59(5):555-560.
  2. Покровская М.В., Покровский В.С., Александрова С.С., Анисимова Н.Ю., Андрианов Р.М., Трещалина Е.М., Пономарев Г.В., Соколов Н.Н., Рекомбинантная внутриклеточная l-аспарагиназа с низкой l-глутаминазной активностью и антипролиферативным эффектом, Биомедицинская химия, 2013, том:59(2), стр:192-208
  3. Pokrovskii V.S., Pokrovskaya M.V., Aleksandrova S.S., Zhdanov D.D., Osmel’yanyuk N.M., Sokolov N.N., Anrianov R.M., Treshchalina E.M., Physicochemical properties and antiproliferative activity of recombinant Yersinia pseudotuberculosis L-asparaginase, Applied Biochemistry and Microbiology, 2013, 49(1), 18-22
  4. Babich O.O., Pokrovsky V.S., Anisimova N.Y., Sokolov N.N., Prosekov A.Y., Recombinant l-phenylalanine ammonia lyase from Rhodosporidium toruloides as a potential anticancer agent, Biotechnology and Applied Biochemistry, 2013, том:60(3),стр:316-322
  5. Абакумова О.Ю., Подобед О.В., Беляева Н.Ф., Точилкин А.И., Противоопухолевая активность оксованадиевых соединений, Биомедицинская химия, 2013, том:59(3), стр:305-320
  6. Гришин Д.В., Молекулярно-генетическая инверсия клеточного цикла: концепция R/K-старения высших эукариот, Успехи современной биологии, 2013, том:133(4), стр:323-332
  7. Коваленко Н.А., Жданов Д.Д., Коваленко Т.Ф., Возможности и эффекты активации теломеразы, Молекулярная биология, 2013, том:47(4), стр:544–557

2012

  1. Pokrovskaya M.V., Aleksandrova S.S., Pokrovsky V.S., Omeljanjuk N.M., Borisova A.A., Anisimova N.Yu., Sokolov N.N. Cloning, expression and characterization of the recombinant Yersinia pseudotuberculosis L-asparaginase. Protein Expr. Purif. (2012) 82(1):150–154.
  2. Pokrovskaya M.V., Pokrovsky V.S., Aleksandrova S.S., Anisimova N.Yu., Andrianov R.M., Treschalina E.M., Ponomarev G.V., Sokolov N.N. Recombinant intracellular Rhodospirillum rubrum L-asparaginase with low L-glutaminase activty and antiproliferative effect. Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry, (2012) 6(2):123-131.
  3. Pokrovsky V.S., Anisimova N.Y., Pokrovskaya M.V., Aleksandrova S.S., Sokolov N.N. Yersinia pseudotuberculosis L-asparaginase: a promising new chemotherapeutic agent. European Journal of Cancer. (2012) 48(Suppl. 5):S219–S220.
  4. Мезенцев Ю.В., Мольнар А.А., Соколов Н.Н., Лисицина В.Б, Шатская М.А., Иванов А.С., Арчаков А.И. Специфичность молекулярного узнавания при олигомеризации бактериальных L-аспарагиназ. Биомед. химия, (2012) 58(1):50-64.
  5. Abakumova O.Yu., Podobed O.V., Belyaeva N.M., Tochilkin A.I. Antineoplastic activity of oxovanadium compounds. Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry, (2012) 6(2):164-170.
  6. Abakumova O.Yu,.Podobed O.V., Karalkin P.F., Kondakova L.I., and Sokolov N.N. Antitumor activity of L-L-asparaginase from Erwinia carotovora against different human and animal leukemic and solid tumor cell lines. Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry (2012) 6(4):306-315.
  7. Kovalenko N. A., Zhdanov D. D., Bibikova M. V, and Gotovtseva V. Y. The Influence of Compound aITEL1296 on Telomerase Activity and Growth of Cancer Cells Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry (2012) 6(1):48–54.

2011

  1. Сидорук К.В., Покровский В.С., Борисова А.А., Омельянюк Н.М., Александрова С.С., Покровская М.В., Гладилина Ю.А., Богуш В.Г., Соколов Н.Н. Создание продуцента, оптимизация экспрессии и очистки рекомбинантной L-аспарагиназы Yersinia pseudotuberculosis. Бюлл. эксперим. биол. и медицины. (2011) 152(8):179-183.
  2. Красоткина Ю.В., Соколов Н.Н. О необходимости создания отечественного противоопухолевого препарата бактериальной аспарагиназы (обзор). Вопросы биол. медицинской и фармацевтической химии (2011) №7:2-9.
  3. Покровская М.В., Покровский В.С., Соколов Н.Н. Дифференциальная среда для выявления штаммов бактерий–продуцентов L-аспарагиназ. Прикладная биохимия и микробиология. (2011) 47(№2):183–186.
  4. Покровский В.С., Покровская М.В., Александрова С.С., Омельянюк Н.М., Соколов Н.Н. Токсичность препаратов L-аспарагиназы и экспериментальные подходы к её снижению. Технологии живых систем (2011) 8(7):11–19.
  5. Mezentsev Yu.V., Mol’nar A.A., Sokolov N.N., Lisitsyna V.B., Shatskaia M.A., Ivanov A.S., Archakov A.I. Specificity of molecular recognition in oligomerization of bacterial L-asparaginases]. Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry, (2011) 5(2):124-134.
  6. Жданов Д. Д., Орлова Е. В. Ингибиторы функций теломер и теломеразы. Молекулярная медицина (2011) № 2:3 – 17.
  7. Коваленко Н. А., Жданов Д. Д., Бибикова М.В., Готовцева В. Ю. Влияние соединения aITEL1296 на теломеразную активность и рост опухолевых клеток. Биомедхимия (2011) 57:501 – 510.
  8. Жданов Д. Д., Соколов Н. Н. Mеханизм альтернативного удлинения теломер в опухолевых клетках. Молекулярная медицина (2011) №5:3-16.

2010

  1. Красоткина Ю.В., Соколов Н.Н. Структурно-функциональные особенности бактериальных L-аспарагиназ 2-го типа». Молекулярная медицина, (2010) №4:11-16.

2009

  1. О.Ю. Абакумова, О.В.Подобед. А..А. Борисова, К.В.Сидорук, С.С.Александрова, Н.М.Омельянюк., М.В.Покровская, Л.И..Кондакова, Н.Н.Соколов. Противоопухолевая активность L-аспарагиназы из Yersinia pseudotuberculosis. Биомедицинская химия, 2009. 54(6) 712-718
  2. O.Yu. Abakumova. O.V. Podobed, A.A. Borisova, K.V. Sidoruk, S.S. Alexandrova, N.M. Omelyanuk, M.V. Pokrovskaya, L.I. Kondakova, and N.N.Sokolov. Antitumor activity of L-asparaginase from Yersinia pseudotuberculosis. Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry (2009) 3(2):198-201.

2008

  1. Abakumova OIu, Podobed OV, Borisova AA, Sidoruk KV, Aleksandrova SS, Omel’ianiuk NM,B Pokrovskaia MV, Kondakova LI, Sokolov NN. Biomed Khim. 2008 Nov-Dec; 54(6):712-9. Russian.
  2. Papageorgiou AC, Posypanova GA, Andersson CS, Sokolov NN, Krasotkina J. Structural and functional insights into Erwinia carotovora L-asparaginase. FEBS J. 2008, 275(17):4306-4316.
  3. Dhavala P, Krasotkina J, Dubreuil C, Papageorgiou AC. Expression, purification and crystallization of Helicobacter pylori L-asparaginase. Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun. 2008, 64(Pt 8):740-742.
  4. Красоткина Ю.В, Гладилина Ю.А., Борисова А.А., Гервазиев Ю.В., Абакумова О.Ю., Занин В.А., Соколов Н.Н. Кинетические свойства и цитотоксическая активность рекомбинантной аспарагиназы Pectobacterium atrosepticum. Вопросы биологической, медицинской и фармацевтической химии, 2008. №3:18-21
  5. Гладилина Ю.А. Соколов Н.Н. Красоткина Ю.В. Клонирование, экспрессия и выделение L-аспарагиназы Helicobacter pylori. Биомедицинская химия, 2008. 54(4):482-486

2007

  1. А.В. Кучумова, Ю.В. Красоткина, П.З. Хасигов, Н.Н. Соколов «Пегилирование рекомбинантной аспарагиназы Erwinia carotovora полиэтиленгликолем 5000» Биомедицинская химия, 2007, 53(1): 107-111.
  2. Yu. V. Mezentsev, A. A. Molnar, O. V. Gnedenko, Yu. V. Krasotkina, N. N. Sokolov and A. S. Ivanov «Oligomerization of L-asparaginase from Erwinia carotovora». Biochemistry (Moscow) B: Biomedical Chemistry, 2007, 1(1): 58-67.
  3. A.V. Kuchumova , Krasotkina Y.V Khasigov P.Z. Sokolov N.N. «Modification of Recombinant Asparaginase from Erwinia Carotovora with Polyethylene Glycol 5000». Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry, 2007, 1(4) 230-232.
  4. Julya Krasotkina1, Michael A. Eldarov, Alexey V. Vorobiev, Victor S. Karasev, Alexander M. Chugunov, and Nikolay N. Sokolov. «The first domestic L-asparaginase drug for leukemia treatment», 2007, ISTC in BioTech, 17

2006

  1. Мезенцев Ю.В., Мольнар А.А., Красоткина Ю.В., Соколов Н.Н., Иванов А.С. «Олигомеризация аспарагиназы Erwinia carotovora», 2006, Биомедицинская химия, 52(3):258-271

2005

  1. Соколов Н. Н., Эльдаров М. А., Сидорук К. В., Жгун А. А., Борисова А. А., Александрова С. С., Омельянюк Н. М., Богуш В. Г., Красоткина Ю. В., Гервазиев Ю. В., Покровская М. В., Соков Б. Н., Березов Т. Т., Скрябин К. Г., Арчаков А. И. Разработка противоопухолевого препарата рекомбинантной L-аспарагиназы Erwinia carotovora. Молекулярная медицина, 2005, (1), 45-53
  2. Wikman Linnea E.K., Krasotkina Ju., Kuchumova A., Sokolov N.N., Papageorgiou A.C. Crystallization and preliminary crystallographic analysis of L-asparaginase from Erwinia carotovora. // Acta Crystallographica. – 2005. – Vol.61(Pt4). – P.407-409.

2004

  1. Krasotkina J., Borisova A.A., Gervaziev Y.V. Sokolov N.N., (2004) “One-step purification and kinetic properties of the recombinant L-asparaginase from Erwinia carotovora.” Appl. Biochem. Biotechnol., 2004 Apr;39(Pt 2):215-21.

2003

  1. Борисова А.А.,Эльдаров М.А.,Жгун А.А.,Александрова .С.С.,Омельянюк Н.М., Соков Б.Н., Березов Т.Т., Соколов Н.Н. (2003) «Выделение, очистка и некоторые свойства рекомбинантной L-аспарагиназы Erwinia carotovora, экспрессированной в клетках E.coli». Биомед. химия, 49(5): 502-507.

2002

  1. Коломейчук С.Н., Абакумова О.Ю.,.Маслов М.А.,.Калашникова Е.А., Морозова Н.Г., Серебренникова Г.А., Швец В.И., Соколов Н.Н. (2002) «Трансфекция эукариотических клеток геном цитохрома CYP450 2В6: появление чувствительности к циклофосфамиду». Вопр.мед.химии, 48(5), 540-552.

2001

  1. Коломейчук С.Н., Покровская М.В., Борисова А.А., Жгун А.А., Солодарь Л.И., Соколов Н.Н., Швец В.И., Гервазиев Ю.В., Эльдаров М.А., Арчаков А.И. (2001) «Клонирование гена цитохрома Р450 2В6 человека в клетках Echerichia coli». Вопр. мед. химии, 47(6): 609-619.
  2. Жгун А.А., Эльдаров М.А., Солодарь Л.И., Соколов Н.Н. Арчаков А.И., Скрябин К.Г. (2001) «Гетерологическая экспрессия эукариотических цитохромов Р450 2В4 с различными концевыми аффинными группами в штаммах E.coli». Вопр. мед. химии, 47(4):382-392.

2000

  1. Соколов Н.Н., Занин В.А., Александрова С.С. (2000) «Бактериальные L-аспарагиназы и глутамин(аспарагиназы): некоторые свойства, строение и противоопухолевая активность». Вопр. мед. химии, 46(6):531-548.
  2. Баснакьян А.Г., Басков А.В., Соколов Н.Н., Борщенко И.А. (2000) «Апоптоз при травматическом повреждении спинного мозга: перспективы фармакологической коррекции». Вопр. мед., химии, 46(5):431-443.

1999

  1. Shumyantseva V.V., Bulko T.V.,.Alexandrova S.S., Schmid R.D., Bachmann T. (1999) “N-terminal truncated cytochrome P450 2B4: catalytic activities and reduction with alternative electron sources”. Biochem. Biophys. Res. Commun., 263(3):678-680.
  2. Соколов Н.Н., Яценко А.Н., Покровская М.В. (1999) «Комбинированная химиотерапия/генотерапия опухолей на основе активации противоопухолевых препаратов генетическими конструкциями цитохромов семейства Р450». Вопр. мед. химии, 45(6):462-471.
  3. Гервазиев Ю.В., Эльдаров М.А., Шкундина И.С., Александрова С.С., Воеводская Н.В., Соколов Н.Н. (1999) «Конструирование системы экспрессии индуцибельной изоформы синтазы оксида азота в клетках Escherichia coli». Вопр. мед. химии, 45(5):416-429.
  4. Гервазиев Ю.В., Соколов Н.Н. (1999) «Механизмы регуляции кальмодулином активности синтазы окиси азота». Вопр. мед. химии, 45(3):187-199.
  5. Соколов Н.Н., Александрова С.С., Омельянюк Н.М., Кирсанова И.Д., Чупырина И.В., Солодарь Л.И., Арчаков А.И. (1999) «Выделение и очистка рекомбинантного «усеченного» (?2-27) цитохрома З450 2В4, экспрессированного в клетках E.coli в составе гибридного белка с глутатион-S-трансферазой». Вопр. мед. химии, 45(1):24-29.

1998

  1. Соколов Н.Н, Королев С.В., Рина М., Эльдаров М.А, Гервазиев Ю.В., Скрябин К.Г., Боуриотис В. (1998) «Новая сайт-специфическая эндонуклеаза из Brevibacterium species». Молекул. генетика, микробиол. и вирусол., N2:35-38.
  2. Королев С.В., Соколов Н.Н., Рина М., Эльдаров М.А., Омельянюк Н.М., Маркаки M., Скрябин К.Г., Боуриотис В. (1998) «Выделение и специфичность новых рестрикционных эндонуклеаз Bsp40091 и AsiI, изошизомеров BamHI». Молекул. генетика, микробиол. и вирусол., №2:32-35.
  3. Sokolov N.N., Eldarov M.A., Rina M, Korolev S.V., Markaki M., Omelyanuk N.M., Skryabin K.G., and Bouriotis V. (1998) “Isolation and characterization of CspBI, a novel NotI isoschizomer from Corynebacterium species B recognizing 5′-GC/GGCCGC-3′ “. Biochem. Mol. Biol. Int., 44(3):433-441.

Тезисы конференций (2005-2017)
2017

2016

  1. Васина Д.А., Жданов Д.Д, Орлова В.С., Соколов Н.Н. Злокачественная трансформация лимфоцитов человека при ингибировании теломеразы цисплатином. V Съезд физиологов СНГ, V Съезд биохимиков России, Конференция ADFLIM, 4-8 октября 2016г., Сочи – Дагомыс – С.13.
  2. Жданов Д.Д., Васина Д.А., Орлова В.С., Покровская М.В., Александрова С.С., Покровский В.С., Соколов Н.Н. Индукция альтернативного сплайсинга каталитической субъединицы теломеразы hTERT апоптотической эндонуклеазой ЕNDOG вызывает гибель клеток. V Съезд физиологов СНГ, V Съезд биохимиков России, Конференция ADFLIM, 4-8 октября 2016г., Сочи – Дагомыс – С.61.
  3. Соколов Н.Н., Гроздова И.Д., Ломакина Г.Ю., Покровская М.В., Покровский В.С., Александрова С.С., Подобед О.В., Гришин Д.В., Гладилина Ю.А., Мелик-Нубаров Н.С. Получение, свойства и перспективы использования пегелированной рекомбинантной L-аспарагиназы ERWINIA CAROTOVORA. V Съезд физиологов СНГ, V Съезд биохимиков России, Конференция ADFLIM, 4-8 октября 2016г., Сочи – Дагомыс – С.154.
  4. Покровская М.В., Эльдаров М.А., Покровский В.С., Александрова С.С., Подобед О.В., Гришин Д.В., Абакумова О.Ю., Гладилина Ю.А., Соколов Н.Н. Мутантные формы L-аспарагиназы I класса RHODOSPIRILLUM RUBRUM. V Съезд физиологов СНГ, V Съезд биохимиков России, Конференция ADFLIM, 4-8 октября 2016г., Сочи – Дагомыс – С.235.

2015

  1. Суховерков К.В., Соколов Н.Н., Абакумова О.Ю., Кудряшова Е.В., Хитопэгилирование как новый подход к улучшению каталитической эффективности и противоопухолевых свойств L-аспарагиназы Erwinia carotovora. VIII Московский международный конгресс «Биотехнология: состояние и перспективы развития», 2015г., Москва
  2. Суховерков К.В., Соколов Н.Н., Абакумова О.Ю., Кудряшова Е.В., ХитоПЭГилирование как новый подход к улучшению каталитической эффективности и противоопухолевых свойств L-аспарагиназы Erwinia carotovora. Всероссийская конференция «Фундаментальные и прикладные аспекты биотехнологии», 2015г., Иркутск
  3. Гришин Д.В., Колесанова Е.Ф., Абакумова О.Ю. Покровская М.В., Соколов Н.Н., Перспективы создания новых полусинтетических антимикробных агентов направленного действия. Всероссийская конференция «Фундаментальные и прикладные аспекты биотехнологии», 2015г., Иркутск

2012

  1. Pokrovsky V.S., Anisimova N.Yu., Pokrovskaya M.V., Aleksandrova S.S., Sokolov N.N. Yersinia pseudotuberculosis L-asparaginase: a promising new chemotherapeutic agent. Abstract book of 22nd Biennial EACR Congress. Barcelona 7-10 July 2012… accepted 02.04.12.

2011

  1. Покровская М.В., Покровский В.С., Омельянюк Н.М., Александрова С.С., Жданов Д.Д., Соколов Н.Н. Продуцент рекомбинантной L-аспарагиназы Rhodospirillum rubrum. Тезисы II международной научно-практической конференций «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинформатика», Новосибирск, 14–17 ноября 2011. — С. 93.
  2. Покровский В.С., Покровская М.В., Александрова С.С., Андрианов Р.М., Жданов Д.Д., Омельянюк Н.М., Соколов Н.Н. Физико-химические и каталитические свойства рекомбинантной L-аспарагиназы Rhodospirillum rubrum Тезисы докладов V Российского симпозиума «Белки и пептиды», Петрозаводск, 8–12 августа 2011. — С. 410.

2010

  1. Olga Yu. Abakumova, Olga V. Podobed, Natal’ya M. Omeljanuk, Svetlana S. Aleksandrova, Marina V. Pokrovskaya, Pavel A. Karalkin, Nikolay N. Sokolov. Recombinant Yersinia Pseudotuberculosis L-Asparaginase. 5th International Conference “Genomics, Proteomics, Bioinformatics and Nanobiotechnology for Medicine” (GPBNM-2010) May 31 – June 5, 2010, Abstract, p. 67.
  2. Yuri V. Mezentsev, Andrey A. Molnar, Nikolay N. Sokolov, Alexandra I. Varenitsa, Valentina L. Migushina, Alexis S. Ivanov. Specificity of Molecular Recognition in oligomerization of Bacterial L-Asparaginases. 5th International Conference “Genomics, Proteomics, Bioinformatics and Nanobiotechnology for Medicine” (GPBNM-2010). May 31 – June 5, 2010, Abstract p. 69.
  3. Dimitry D. Zdanov, Natalia A. Kovalenko, Olga Y. Abakumova, Margarita V. Bibikova, Varvara Y. Gotovtseva. “Telomerase Inhibitor Suppresses Growth of Cancer Cells in Vitro. 5th International Conference “Genomics, Proteomics, Bioinformatics and Nanobiotechnology for Medicine” (GPBNM-2010). May 31 – June 5, 2010, Abstract p. 70.

2009

  1. Покровский В.С., Покровская М.В., Александрова С.С., Омельянюк Н.М., Гладилина Ю.А., Соколов Н.Н. Термостабильность рекомбинантных L-аспарагиназ Yersinia pseudoyuberculosis и Erwinia carotovora. // Сборник материалов VI международной конференции «Молекулярная медицина и биобезопасность» — 10-11 ноября 2009г. – С.185-187.
  2. Покровский В.С., Сидорук К.В., Богуш В.Г., Омельянюк Н.М., Покровская М.В., Александрова С.С., Борисова А.А., Гладилина Ю.А., Соколов Н.Н. Некоторые свойства рекомбинантной L-аспарагиназы Yersinia pseudotuberculosis. // Сборник материалов Научно-практической конференции с международным участием «Совершенствование медицинской помощи при онкологических заболеваниях, включая актуальные проблемы детской гематологии и онкологии. Национальная онкологическая программа». VII съезд онкологов России. — 29-30 октября 2009г. – Том I – С.76-77.

2008

  1. Nikolai N. Sokolov, Anastasia V. Kuchumova, Julia A. Leonova, Yuri V. Gervaziev and Julia Krasotkina. A new bacterial L-asparaginase for leukemia treatment. 4th International Conference “Genomics, Proteomics, Bioinformatics and Nanobiotechnologies for Medicine”. Russia, June 1-7, 2008, p.66.
  2. Красоткина Ю.В., Посыпанова Г.А., Соколов Н.Н. Разработка лекарственного препарата бактериальной аспарагиназы для химиотерапии лейкозов. Российский биотерапевтический журнал. Материалы Всероссийской научно-практической конференции «Отечественные противоопухолевые препараты, Москва 17-19 марта 2008 г. с.45-46.
  3. Кучумова А.В., Соколов Н.Н., Красоткина Ю.В. Модификация рекомбинантной аспарагиназы Pectobacterium atrosepticum полиэтиленгликолем. Российский биотерапевтический журнал. Материалы Всероссийской научно-практической конференции «Отечественные противоопухолевые препараты, Москва 17-19 марта 2008 г., с.46-47.
  4. Абакумова О.Ю., Подобед О.В., Богуш В.Г., Сидорук К.В., Александрова С.С., Омельянюк Н.М., Борисова А.А., Покровская М.В., Соколов Н.Н. Противоопухолевая активность L-аспарагиназы из Yersinia pseudotuberculosis. IV съезд Российского общества биохимиков и молекулярных биологов. 11-15 мая 2008 г., Новосибирск, № 599, с. 343.
  5. Кучумова А.В., Красоткина Ю.В. Пегилирование аспарагиназы Erwinia carotovora усиливает терапевтически значимые свойства фермента. IV съезд Российского общества биохимиков и молекулярных биологов. 11-15 мая 2008 г., Новосибирск, №617, с. 352.

2007

  1. Ю.В. Красоткина, «Олигомерный состав бактериальной аспарагиназы». 3rd International Conference Basic Science for Medicine, 2007, Новосибирск, 131.
  2. А.В. Кучумова, Ю.В. Красоткина, Н.Н. Соколов «Пегилирование аспарагиназы Erwinia carotovora c полиэтиленгликолем 5000 cнижает антигенность фермента», 3rd International Conference Basic Science for Medicine, 2007, Новосибирск, 135.
  3. Красоткина Ю.В., Леонова Ю.А. «Выделение и очистка рекомбинантной аспарагиназы Helicobacter pylori». Сборник докладов научно-практической конференции с международным участием «Актуальные проблемы экспериментальной и клинической медицины» Волгоград, 2007, 25-26
  4. Ю.А. Леонова, Н.Н. Соколов, Ю.В. Красоткина «Клонирование рекомбинантной аспарагиназы Helicobacter pylori», Материалы IV Международной научной конференции «Перспективы современной медицинской науки», Винница, Украина, 2007, 167.

2006

  1. Красоткина Ю.В., Кучумова А.В., Соколов Н.Н. «Цитотоксическая активность аспарагиназы зависит от ее глутаминазной специфичности». Молекулярные основы и клинические проблемы резистентности к лекарственным средствам, Киев, Украина, 2006, 31.
  2. N.N. Sokolov, Y.V. Krasotkina, M.A.Eldarov, V.G Bogush, K.V. Sidoruk, S.S. Alexandrova, N.M Omelyanuk, A.V.Kuchumova, A.A. Jgoun, S.P. Rybalkin, N.R. Dyadyschev, Ju.V.Ivanova, A.I. Archakov, K.G Skryabin «Recombinant Erwinia carotovora L-asparaginase – development of the experimental-industrial technology for production of substance, pharmacological preparations, preclinical trials, structure-functional studies and creation of modified forms with improved pharmacological properties».. 3rd International Conference “Genomics, Proteomics, Bioinformatics and Nanotechnologies for Medicine” July 2006, Novosibirsk, Russia. Abstracts, 38.

2005

  1. Красоткина Ю.В., Абакумова О.Ю., Подобед О.В., Медников А.В., Кучумова А.В., Соколов Н.Н. Влияние стабильности бактериальной аспарагиназы Erwinia carotovora на ее противоопухолевую активность in vitro. // Сборник докладов II научно-практической конференции «Актуальные проблемы медицинской биотехнологии». – Анапа. – 2005. – С.3.
  2. Красоткина Ю.В., Абакумова О.Ю., Подобед О.В., Медников А.В., Кучумова А.В., Соколов Н.Н. Цитостатическая активность рекомбинантной L-аспарагиназы Erwinia carotovora. // Сборник докладов II научно-практической конференции «Актуальные проблемы медицинской биотехнологии». – Анапа. – 2005. – С.2.

Патенты

  1. Гришин Д.В., Соколов Н.Н., Абакумова О.Ю., Подобед О.В., Покровская М.В., Александрова С.С. Способ получения рекомбинантного эластомерного домена Trib-2mut, генно-инженерная конструкция pGDTrib2mut, определяющая биосинтез Trib-2mut в клетках E.coli, штамм-продуцент E. coli М15/ pGDTrib2mut и способ получения полимерного материала на основе данного белка, 2017, номер 2631004.
  2. Патент на изобретение РФ №2221868. Эльдаров М.А., Жгун А.А., Гервазиев Ю.В., Арчаков А.И., Скрябин К.Г., Александрова С.С., Омельянюк Н.М., Арчаков А.И., Скрябин К.Г., Соколов Н.Н. «Ген L-аспарагиназы Erwinia carotovora и штамм Escherichia coli ВКПМ №В-8174 – продуцент L-аспарагиназа Erwinia carotovora» . Положительное решение от 26.05.2003 г. Заявка №2001123442/13 от 22.08.2001 г.
  3. Патент на изобретение РФ №2224797. Эльдаров М.А., Жгун А.А., Гервазиев Ю.В., Александрова С.С., Богуш В.Г., Сидорук К.В., Свешникова Е.В., Борисова А.А., Омельянюк Н.М., Арчаков А.И., Скрябин К.Г., Соколов Н.Н. «Рекомбинантная плазмидная ДНК pACYCLANS для переноса и экспрессии в клетках Escherichia coli L-аспарагиназы Erwinia carotovora (ECAR-LANS) и способ получения рекомбинантной ECAR-LANS из биомассы штамма Escherichia coli-продуцента». Положительное решение от 23.09.2003 г. Заявка №2002108505/13 от 04.04.2002 г.
  4. Патент на изобретение РФ №2398876. Покровская М.В., Соколов Н.Н., Покровский В.С., Арчаков А.И., Гусева Д.А, «Способ выявления штаммов бактерий-продуцентов L-аспарагиназы». Заявка на изобретение №026188, приоритет от 03.06.08. Решение о выдаче патента на изобретение от 07.04.2010.
  5. Патент на изобретение РФ №2376020. Точилкин А.И., Беляева Н.Ф., Абакумова О.Ю., Подобед О.В. Средство, проявляющее противоопухолевую активность. Приоритет от 26.03.2008.
  6. Патент на изобретение РФ №2441916. Сидорук К.В., Богуш В.Г., Эльдаров М.А., Гончарова О.В., Чугунова Н.М., Покровская М.В., Александрова С.С., Омельянюк Н.М., Соколов Н.Н. Рекомбинантная плазмидная ДНК pACYC_LANS(KM), штамм Escherichia coli L21(DE3), трансформированный рекомбинантной ДНК pACYC_LANS(KM), и способ получения рекомбинантной L-аспарагиназы Erwinia carotovora. Приоритет от 06.10.2010.
  7. Патент на изобретение РФ №2441914.Карасев В.С., Бочкова О.П., Чугунов А.М., Мелик-Нубаров Н.С., Гроздова И.Д., Черновская Т.В., Денисов Л.А., Руденко Е.Г., Морозова Е.Л., Богуш В.Г., Сидорук К.В., Колтун И.О., Скатова Г.Е., Соколов Н.Н. Способ получения субстанции рекомбинантной L-аспарагиназы Erwinia carotovora. Приоритет от 06.10.2010.
  8. РСТ Patent, 2003, number: WO03018742. «The recombinant L-asparaginase Erwinia carotovora Application number: WO2002RU00405 20020821.

Партнеры

  • ФИЦ «Центр биотехнологии РАН» (группа генетической инженерии грибов)
  • ФИЦ «Центр биотехнологии РАН (лаборатория биомедицинских исследований)
  • ФГБУН НИЦ ТБП ФМБА России (г. Серпухов, Московская обл.)
  • Биотехнологическая компания ЗАО «Биокад» (Петрово-Дальнее, Московская обл.)
  • ФГБУ «РОНЦ им. Н.Н.Блохина» Минздрава России
  • ЗАО «БиоХимМак» «СТ»
  • ГНЦ РФ ФГУП «ГосНИИгенетика»
  • РУДН медицинский факультет, кафедра биохимии
  • Лаборатория лекарственной токсикологии ФГУ «Российский кардиологический научно-производственный комплекс» Минздравсоцразвития России
  • Химфак МГУ им. М.В. Ломоносова

Международное научное сотрудничество

  • Basnakian A. Ph.D, Associate Professor University of Arkansas for Medical Sciences, Department of Pharmacology & Toxicology (Little-Rock, USA)
  • Papageorgiou T. A., Ph.D., Turku Centre for Biotechnology, University of Turku (Turku, Finland)
  • Bouriottis V. Ph.D, Institute of Molecular Biology and Biotechnology (Heraklion, Crete, Greece)
  • Charles O. Rock Ph.D., Sima Jeha Ph.D., Richard Heath Ph.D., St. Jude Children’s Research Hospital (Memphis, USA)
  • Center for Molecular Biology and Gene Therapy, Loma Linda University, (Loma Linda, USA)